Genau grundsätzlich hast du als User nur zugriff auf dein Homeverzeichniss. Was auch gut so ist. Auf die anderen Ordner wirste eh sehr selten zugreifen müssen.
Wenn du etwas offline installieren willst musst du *.deb pakete herunterladen, die lassen sich dann einfach per rechtsklick
installieren, installieren.
Anleitungen zb. für deinen Ati-Treiber gibt es im wiki welches FlashKid oben ja schon verlinkt hat.