Vielleicht startet ein Hintergrundprogramm eine Cursor-Blink-Schleife, die sich auch nicht mehr nur durch ein Ende des Programms beenden lässt. Mal alle nicht zwingend nötigen Prozesse in „[Win]+[R]
msconfig
Systemstart“ deaktivieren und/oder im abgesicherten Modus starten und schauen ob es dann auch noch passiert.
Wenn es sich dadurch bessert, kann man ja nach und nach wieder die Autostarts aktivieren und sieht dann, welcher der Schuldige ist.
Edit:
Und alle nicht benötigte Hardware abstöpseln (auch z.B. integrierte Kartenleser oder USB-/Firewire-Hubs/Verlängerungen,die hinten oder innen angeschlossen sind) – vielleicht macht die sich durch irgend eine stille Tätigkeit bemerkbar.